森可成雖積極反擊，但淺見道西、淺井政元又領(lǐng)2千人來夾擊，朝倉景恆、山崎吉家、阿波賀三郎也領(lǐng)兵來圍攻，甚至連淺井長(zhǎng)政亦率領(lǐng)本隊(duì)參與攻勢(shì)，兩家兵馬持續(xù)包圍森可成的部隊(duì)，儘管森可成奮勇作戰(zhàn)，在敵軍猛攻下依然崩潰戰(zhàn)敗，森可成被淺井家臣石田十藏討取、織田信治被朝倉家臣大陽寺右馬助討取（來迎寺要書），而青地茂綱、尾藤源內(nèi)、尾藤又八、道家清十郎、助十郎兄弟等織田家將領(lǐng)也戰(zhàn)死（信長(zhǎng)公記 卷三）（淺井三代記 卷十五），織田軍有陣亡數(shù)百人（市川文書）、陣亡3百人（尋憲記）、陣亡7百人（朝倉記）等說法?擊潰森可成部隊(duì)的淺井、朝倉聯(lián)軍順勢(shì)進(jìn)攻宇佐山城，但留守城內(nèi)的武藤兼友、肥田忠政、林通安的奮佔(zhàn)下，城池始終未被攻陷翌20日，淺井、朝倉聯(lián)軍出大津至馬場(chǎng)、松本一帶放火，21日時(shí)又越過逢坂，到京都附近的醍醐、山科放火（信長(zhǎng)公記 卷三）?９月24日時(shí)，織田信長(zhǎng)從攝津撤軍，以柴田勝家殿後，全軍撤往京都，織田信長(zhǎng)在護(hù)送將軍足利義昭回到京都後，領(lǐng)軍越過逢坂至下坂本布陣迎戰(zhàn)淺井、朝倉聯(lián)軍，並在本濱、白川一帶放火（中山家記），並且商請(qǐng)盟友德川家康援助，家康便在10月時(shí)派遣家臣酒井忠次、石川家成、松平伊忠、本多康重、松平忠次領(lǐng)2千人往北近江助戰(zhàn)（神君御年譜）（續(xù)本朝通鑑 二百一），也有派遣石川家成、松平信一率領(lǐng)3千人支援的說法（松平記）但淺井、朝倉聯(lián)軍一看到織田信長(zhǎng)的旗印，便迅速退往比叡山，在蜂峰、青山、局笠山一帶佈陣?織田信長(zhǎng)招來延暦寺的僧人十名，表示以歸還山門領(lǐng)地為條件，要求他們不可幫助，淺井、朝倉聯(lián)軍，若僧眾拒絕，則將燒毀比叡山根本中堂、三王二十一社但延暦寺僧眾並不同意織田信長(zhǎng)提出的條件交換，堅(jiān)持繼續(xù)幫助淺井、朝倉聯(lián)軍（信長(zhǎng)公記 卷三）?織田信長(zhǎng)透過佐久間信盛跟稻葉一鐵招來延暦寺的僧人十名，表示以歸還山門領(lǐng)地為條件，要求他們不可幫助，淺井、朝倉聯(lián)軍，若僧眾拒絕，則將燒毀比叡山根本中堂、三王二十一社但延暦寺僧眾並不同意織田信長(zhǎng)提出的條件交換，堅(jiān)持繼續(xù)幫助淺井、朝倉聯(lián)軍（信長(zhǎng)公記 卷三）（淺井三代記 卷十五）朝倉軍討取1583人討捕，朝倉義景也坂本一帶進(jìn)行頸實(shí)檢（朝倉始末記 卷五），但也有織田軍陣亡數(shù)百人（東寺光明講過去帳），朝倉、淺井聯(lián)軍陣亡8百人、織田軍的陣亡5百人（言繼卿記），織田軍陣亡數(shù)千人（中山家記），織田軍陣亡千餘人、朝倉、淺井聯(lián)軍陣亡6.7百人（尋憲記），織田軍陣亡8百人（松平記）等說法在時(shí)節(jié)步入冬天後，因?yàn)榻笛┦贡眹耐繁环忾]，經(jīng)由將軍足利義昭出面，派遣二階堂孝秀為使者，企圖促成朝倉義景跟織田信長(zhǎng)的和談，並在11月30日時(shí)足利義昭跟朝廷共同出面斡旋，朝廷方面也下旨要織田信長(zhǎng)、朝倉義景同意和談，在關(guān)白二條晴良敦促下，雙方終於同意休戰(zhàn)（信長(zhǎng)公記 卷三）（武德編年集成）（伏見宮御紀(jì)錄）（公卿補(bǔ)任）（尋憲記）但何以足利義昭與朝廷會(huì)出面斡旋，各書則說法不一，《續(xù)本朝通鑑》、《信長(zhǎng)公記》聲稱是朝倉、淺井兩家向?qū)④娺M(jìn)言，希望雙方議和，而《朝倉始末記》則表示是織田信長(zhǎng)奏請(qǐng)12月13日，織田信長(zhǎng)跟淺井長(zhǎng)政、朝倉義景正式講和，互相交換請(qǐng)起文，織田軍渡過湖水從瀨田撤退，淺井、朝倉聯(lián)軍則由高島郡退離

翌14日，織田信長(zhǎng)按照約定經(jīng)由瀬田的山岡景隆居城撤軍，淺井、朝倉聯(lián)軍隨後在15日早晨從比叡山下山返回領(lǐng)地（信長(zhǎng)公記 卷三）（細(xì)川兩家記）（歷代古案），織田信長(zhǎng)在12月17日回歸岐阜城（信長(zhǎng)公記 卷三）。

《三河物語》中則聲稱織田信長(zhǎng)在跟朝倉義景交換誓書時(shí)，表示天下全歸朝倉家所有

《續(xù)本朝通鑑》則紀(jì)錄，織田信長(zhǎng)暗中跟丹羽長(zhǎng)秀、水野信元表示雙方再戰(zhàn)之期不遠(yuǎn)，要丹羽長(zhǎng)秀想方法攻下淺井家的佐和山城。